基于RNA测序的致癌基因与抑癌基因表达的研究

样本要求

样品类型           癌组织与癌旁组织

样品量              RNA浓度>200ng/ul，总RNA>6ug，无明显降解

组织样本量       新鲜或冰冻肿瘤组织10-30mg

新鲜全血          需加RNA保护剂，3-5ml

石蜡包埋样本   A. 石蜡切片10张

                       B. 石蜡块约为30mg的组织样本


案例一 结合长非编码RNAs、关键驱动基因突变和泛癌转录组的分析
文章出处 在2016年发表在《Nature Communications》杂志上，IF（2017）：12.124
样本类型 7295名患者
技术方案 RNA-seq
研究结果 相关癌种的lncRNA的特征相同，驱动基因突变影响mRNA的表达也影响lncRNA的表达，比如TP53的突变影响CDKN、LINC01021、RP3-510D11.2、RP11-115D19.1的表达，CTNNAB1的突变影响RP11-401P9.6、NKD1的表达。

图1：相同癌种的lncRNA的特征相同
图2：驱动基因的突变影响mRNA的表达
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