个体化诊疗包含个体化诊断以及个体化用药2个方面。其中,把基因检测纳入诊疗体系中,为病人确定病因、选择合适的治疗手段、合适的药物及剂量等提供了参考。
近年来随着肿瘤基因组学、遗传药理学和药物基因组学的飞速发展,通过基因检测确定肿瘤是否是遗传性的、是否适合靶向药物治疗、是否适合免疫药物治疗,适合多大剂量的放疗和什么类型的化疗等,使肿瘤患者的临床获益越来越明显。此外基因检测也可以对患者做治疗后疗效评估、以及优化治疗方案等方面提供参考。
全外显子测序,也称目标外显子组捕获,是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。虽然外显子仅占人类全部基因组序列的约1% ,但包含大约85%的致病突变。除了能检测常规的基因突变,全外显子测序还能检测到其他和肿瘤密切相关的信息,例如微卫星不稳定性(MSI)、基因错配损伤修复(MMR)、肿瘤突变负荷(TMB)和大片段缺失、插入、扩增以及基因融合等变异信息。对这些信息的掌握可以在很大程度上给患者提供更多的临床治疗选择。因此,全外显子组检测已被广泛应用于肿瘤患者临床治疗,通过测序数据的分析与解读,帮助临床医师优化治疗方法,使患者最大受益。
天佳基因是一家专注于基因组大数据分析解读的公司。作为支撑国家大基因中心的精准医疗核心团队,天佳基因由多名具有10多年数据分析解读及肿瘤研究经验的名校海归博士组成,公司建立了独有的临床解读数据库,全面助力肿瘤诊疗临床报告解读。
精准用药信息指导:一次性快速检测肿瘤基因变异信息,结合来自CFDA(中国食品和药物管理局)、FDA(美国食品和药物管理局)、NCCN(美国国家综合癌症网)指南等权威信息,为临床治疗方案的选择、靶向、化疗用药等提供优选方案。
免疫检查点抑制剂获益评估相关检测:检测微卫星不稳定性和肿瘤突变负荷,为医生和患者提供是否选择免疫检查点抑制剂进行治疗。
全景解析基因突变:解读全面展现原癌基因及抑癌基因突变、肿瘤高频突变基因、与靶向药物相关基因突变、和肿瘤信号通路相关基因变异信息。
针对肿瘤特征的遗传突变检测:高效检出遗传性肿瘤相关的致病突变,预知特定肿瘤发生的风险,为患者家属的患癌风险提供精准的评估。
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1、 肿瘤免疫治疗与基因检测
肿瘤免疫治疗被认为是最有可能攻克肿瘤的方法,其中免疫检查点抑制剂治疗是免疫治疗的重中之重,该方法可以阻断免疫抑制信号的传递,逆转肿瘤免疫微环境,恢复T细胞抗肿瘤活性。近年免疫检查点阻断疗法取得了突飞猛进发展,颠覆了多种晚期癌症常规治疗,并取得了令人震惊的疗效。目前靶向免疫检查点蛋白CTLA-4、 PD-1/PD-L1的单克隆抗体已经被批准用于治疗多种类型的恶性肿瘤。但临床试验表明并不是所有患者都能从免疫治疗中获益,盲目的治疗可能非但不能取得好的疗效同时会增加不必要的治疗费用,通过大量研究发现,微卫星不稳定性和肿瘤突变负荷可以作为评估肿瘤免疫检查点抑制剂治疗获益与否的可靠指标。
2、 微卫星不稳定性(MSI)
微卫星又被称为短串联重复序列,是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成。微卫星不稳定性(MSI)表现为同一微卫星位点在不同个体之间或者同一个体的正常组织与某些异常组织之间重复单位的数目不同,造成MSI的主要原因是DNA错配修复(MMR)功能缺陷。MMR系统基因的失活会导致个体自发突变率的明显增加,进而导致MSI和整个基因组的不稳定性,造成细胞增殖分化异常和肿瘤的发生。
研究显示,微卫星不稳定性与肿瘤患者免疫抑制剂获益密切相关(图1)。
图1:MMR基因状态对pembrolizumab治疗效益有影响
3、 肿瘤突变负荷(TMB)
肿瘤突变负荷(TMB)被定义为每百万碱基中被检测出的,体细胞基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数。因此理论上TMB越高,最后能够被T细胞识别的新抗原产生也越多,越容激发免疫系统对其杀伤。
因此,肿瘤突变负荷与肿瘤患者免疫抑制剂获益密切相关(图2)。
图2:肿瘤突变负荷越高,癌症免疫治疗药物的成功率就越高
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